폭발적인 인구 증가로 인해 더 이상 사람이 거주할 공간이 없게 된 지구. 생존권을 위협받는 상황을 해결하고자 바다로 눈을 돌린 인류는 국가간의 이권과 환경보호 등의 해상 분쟁을 총괄 담당하는 범세계적인 기구, '청(Blue)'을 설립한다. 해양의 치안관리를 위해 각국에서는 잠수함을 파견하게 되고, 일본에서는 '청의 6호'를 파견한다. 그러나 청에 소속된 과학자 존다이크는 이에 반발하여 해양테러를 감행, 남극기지를 점령하고 생체병기 '무스카'를 개발해 청의 전투력을 무력화시키는 한편 해양 생명체의 유전자 조작을 통한 신인류의 번성을 꿈꾼다. 존다이크와 청의 대결에 전 세계는 황폐되고 ,존다이크에 맞서는 청의 6호의 승무원 키노는 과거 6호의 엘리트 대원이었던 하야미를 회유하기 위해 그를 찾아온다. 하야미가..
